Еще в 2001 году, будучи игроком "Брешии", Гвардиола был подвергнут четырехмесячной дисквалификации, так как в его допинг-пробах якобы были обнаружены следы запрещенного вещества нандролона. Хавбек не согласился с обвинениями и подал апелляцию. После восьми лет судебных тяжб федерация согласилась признать неправоту.